上海城投水务（集团）有限公司实行董事会领导下的总经理负责制，下设9个职能部门和5个专业管理中心；下属原水公司、制水公司、供水公司、浦威公司、排水公司、污水公司、水务建设、水中心8家核心企业和5家其他企业。